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27丨K-Means(下):如何使用K-Means对图像进行分割?

2019-02-13 陈旸
数据分析实战45讲
进入课程

讲述:陈旸

时长08:49大小8.09M

上节课,我讲解了 K-Means 的原理,并且用 K-Means 对 20 支亚洲球队进行了聚类,分成 3 个梯队。今天我们继续用 K-Means 进行聚类的实战。聚类的一个常用场景就是对图像进行分割。

图像分割就是利用图像自身的信息,比如颜色、纹理、形状等特征进行划分,将图像分割成不同的区域,划分出来的每个区域就相当于是对图像中的像素进行了聚类。单个区域内的像素之间的相似度大,不同区域间的像素差异性大。这个特性正好符合聚类的特性,所以你可以把图像分割看成是将图像中的信息进行聚类。当然聚类只是分割图像的一种方式,除了聚类,我们还可以基于图像颜色的阈值进行分割,或者基于图像边缘的信息进行分割等。

将微信开屏封面进行分割

上节课,我讲了 sklearn 工具包中的 K-Means 算法使用,我们现在用 K-Means 算法对微信页面进行分割。微信开屏图如下所示:


我们先设定下聚类的流程,聚类的流程和分类差不多,如图所示:


在准备阶段里,我们需要对数据进行加载。因为处理的是图像信息,我们除了要获取图像数据以外,还需要获取图像的尺寸和通道数,然后基于图像中每个通道的数值进行数据规范化。这里我们需要定义个函数 load_data,来帮我们进行图像加载和数据规范化。代码如下:

# 加载图像,并对数据进行规范化
def load_data(filePath):
# 读文件
f = open(filePath,'rb')
data = []
# 得到图像的像素值
img = image.open(f)
# 得到图像尺寸
width, height = img.size
for x in range(width):
for y in range(height):
# 得到点 (x,y) 的三个通道值
c1, c2, c3 = img.getpixel((x, y))
data.append([c1, c2, c3])
f.close()
# 采用 Min-Max 规范化
mm = preprocessing.MinMaxScaler()
data = mm.fit_transform(data)
return np.mat(data), width, height
复制代码

因为 jpg 格式的图像是三个通道 (R,G,B),也就是一个像素点具有 3 个特征值。这里我们用 c1、c2、c3 来获取平面坐标点 (x,y) 的三个特征值,特征值是在 0-255 之间。

为了加快聚类的收敛,我们需要采用 Min-Max 规范化对数据进行规范化。我们定义的 load_data 函数返回的结果包括了针对 (R,G,B) 三个通道规范化的数据,以及图像的尺寸信息。在定义好 load_data 函数后,我们直接调用就可以得到相关信息,代码如下:

# 加载图像,得到规范化的结果 img,以及图像尺寸
img, width, height = load_data('./weixin.jpg')
复制代码

假设我们想要对图像分割成 2 部分,在聚类阶段,我们可以将聚类数设置为 2,这样图像就自动聚成 2 类。代码如下:

# 用 K-Means 对图像进行 2 聚类
kmeans =KMeans(n_clusters=2)
kmeans.fit(img)
label = kmeans.predict(img)
# 将图像聚类结果,转化成图像尺寸的矩阵
label = label.reshape([width, height])
# 创建个新图像 pic_mark,用来保存图像聚类的结果,并设置不同的灰度值
pic_mark = image.new("L", (width, height))
for x in range(width):
for y in range(height):
# 根据类别设置图像灰度, 类别 0 灰度值为 255, 类别 1 灰度值为 127
pic_mark.putpixel((x, y), int(256/(label[x][y]+1))-1)
pic_mark.save("weixin_mark.jpg", "JPEG")
复制代码

代码中有一些参数,我来给你讲解一下这些参数的作用和设置方法。

我们使用了 fit 和 predict 这两个函数来做数据的训练拟合和预测,因为传入的参数是一样的,我们可以同时进行 fit 和 predict 操作,这样我们可以直接使用 fit_predict(data) 得到聚类的结果。得到聚类的结果 label 后,实际上是一个一维的向量,我们需要把它转化成图像尺寸的矩阵。label 的聚类结果是从 0 开始统计的,当聚类数为 2 的时候,聚类的标识 label=0 或者 1。

如果你想对图像聚类的结果进行可视化,直接看 0 和 1 是看不出来的,还需要将 0 和 1 转化为灰度值。灰度值一般是在 0-255 的范围内,我们可以将 label=0 设定为灰度值 255,label=1 设定为灰度值 127。具体方法是用 int(256/(label[x][y]+1))-1。可视化的时候,主要是通过设置图像的灰度值进行显示。所以我们把聚类 label=0 的像素点都统一设置灰度值为 255,把聚类 label=1 的像素点都统一设置灰度值为 127。原来图像的灰度值是在 0-255 之间,现在就只有 2 种颜色(也就是灰度为 255,和灰度 127)。

有了这些灰度信息,我们就可以用 image.new 创建一个新的图像,用 putpixel 函数对新图像的点进行灰度值的设置,最后用 save 函数保存聚类的灰度图像。这样你就可以看到聚类的可视化结果了,如下图所示:


上面是分割成 2 个部分的分割可视化,完整代码见这里

https://github.com/cystanford/kmeans/blob/master/kmeans1.py

如果我们想要分割成 16 个部分,该如何对不同分类设置不同的颜色值呢?这里需要用到 skimage 工具包,它是图像处理工具包。你需要使用 pip install scikit-image 来进行安装。

这段代码可以将聚类标识矩阵转化为不同颜色的矩阵:

from skimage import color
# 将聚类标识矩阵转化为不同颜色的矩阵
label_color = (color.label2rgb(label)*255).astype(np.uint8)
label_color = label_color.transpose(1,0,2)
images = image.fromarray(label_color)
images.save('weixin_mark_color.jpg')
复制代码

代码中,我使用 skimage 中的 label2rgb 函数来将 label 分类标识转化为颜色数值,因为我们的颜色值范围是 [0,255],所以还需要乘以 255 进行转化,最后再转化为 np.uint8 类型。unit8 类型代表无符号整数,范围是 0-255 之间。

得到颜色矩阵后,你可以把它输出出来,这时你发现输出的图像是颠倒的,原因可能是图像源拍摄的时候本身是倒置的。我们需要设置三维矩阵的转置,让第一维和第二维颠倒过来,也就是使用 transpose(1,0,2),将原来的 (0,1,2)顺序转化为 (1,0,2) 顺序,即第一维和第二维互换。

最后我们使用 fromarray 函数,它可以通过矩阵来生成图片,并使用 save 进行保存。

最后得到的分类标识颜色化图像是这样的:


完整的代码见这里

https://github.com/cystanford/kmeans/blob/master/kmeans2.py

刚才我们做的是聚类的可视化。如果我们想要看到对应的原图,可以将每个簇(即每个类别)的点的 RGB 值设置为该簇质心点的 RGB 值,也就是簇内的点的特征均为质心点的特征。

我给出了完整的代码,代码中,我可以把范围为 0-255 的数值投射到 1-256 数值之间,方法是对每个数值进行加 1,你可以自己来运行下:

# -*- coding: utf-8 -*-
# 使用 K-means 对图像进行聚类,并显示聚类压缩后的图像
import numpy as np
import PIL.Image as image
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn import preprocessing
import matplotlib.image as mpimg
# 加载图像,并对数据进行规范化
def load_data(filePath):
# 读文件
f = open(filePath,'rb')
data = []
# 得到图像的像素值
img = image.open(f)
# 得到图像尺寸
width, height = img.size
for x in range(width):
for y in range(height):
# 得到点 (x,y) 的三个通道值
c1, c2, c3 = img.getpixel((x, y))
data.append([(c1+1)/256.0, (c2+1)/256.0, (c3+1)/256.0])
f.close()
return np.mat(data), width, height
# 加载图像,得到规范化的结果 imgData,以及图像尺寸
img, width, height = load_data('./weixin.jpg')
# 用 K-Means 对图像进行 16 聚类
kmeans =KMeans(n_clusters=16)
label = kmeans.fit_predict(img)
# 将图像聚类结果,转化成图像尺寸的矩阵
label = label.reshape([width, height])
# 创建个新图像 img,用来保存图像聚类压缩后的结果
img=image.new('RGB', (width, height))
for x in range(width):
for y in range(height):
c1 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 0]
c2 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1]
c3 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]
img.putpixel((x, y), (int(c1*256)-1, int(c2*256)-1, int(c3*256)-1))
img.save('weixin_new.jpg')
复制代码

完整代码见这里

https://github.com/cystanford/kmeans/blob/master/kmeans3.py

你可以看到我没有用到 sklearn 自带的 MinMaxScaler,而是自己写了 Min-Max 规范化的公式。这样做的原因是我们知道 RGB 每个通道的数值在 [0,255] 之间,所以我们可以用每个通道的数值 +1/256,这样数值就会在 [0,1] 之间。

对图像做了 Min-Max 空间变换之后,还可以对其进行反变换,还原出对应原图的通道值。

对于点 (x,y),我们找到它们所属的簇 label[x,y],然后得到这个簇的质心特征,用 c1,c2,c3 表示:

c1 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 0]
c2 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1]
c3 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]
复制代码

因为 c1, c2, c3 对应的是数据规范化的数值,因此我们还需要进行反变换,即:

c1=int(c1*256)-1
c2=int(c2*256)-1
c3=int(c3*256)-1
复制代码

然后用 img.putpixel 设置点 (x,y) 反变换后得到的特征值。最后用 img.save 保存图像。

总结

今天我们用 K-Means 做了图像的分割,其实不难发现 K-Means 聚类有个缺陷:聚类个数 K 值需要事先指定。如果你不知道该聚成几类,那么最好会给 K 值多设置几个,然后选择聚类结果最好的那个值。

通过今天的图像分割,你发现用 K-Means 计算的过程在 sklearn 中就是几行代码,大部分的工作还是在预处理和后处理上。预处理是将图像进行加载,数据规范化。后处理是对聚类后的结果进行反变换。

如果涉及到后处理,你可以自己来设定数据规范化的函数,这样反变换的函数比较容易编写。

另外我们还学习了如何在 Python 中如何对图像进行读写,具体的代码如下,上文中也有相应代码,你也可以自己对应下:

import PIL.Image as image
# 得到图像的像素值
img = image.open(f)
# 得到图像尺寸
width, height = img.size
复制代码

这里会使用 PIL 这个工具包,它的英文全称叫 Python Imaging Library,顾名思义,它是 Python 图像处理标准库。同时我们也使用到了 skimage 工具包(scikit-image),它也是图像处理工具包。用过 Matlab 的同学知道,Matlab 处理起图像来非常方便。skimage 可以和它相媲美,集成了很多图像处理函数,其中对不同分类标识显示不同的颜色。在 Python 中图像处理工具包,我们用的是 skimage 工具包。

这节课没有太多的理论概念,主要讲了 K-Means 聚类工具,数据规范化工具,以及图像处理工具的使用,并在图像分割中进行运用。其中涉及到的工具包比较多,你需要在练习的时候多加体会。当然不同尺寸的图像,K-Means 运行的时间也是不同的。如果图像尺寸比较大,你可以事先进行压缩,长宽在 200 像素内运行速度会比较快,如果超过了 1000 像素,速度会很慢。


今天我讲了如何使用 K-Means 聚类做图像分割,谈谈你使用的体会吧。另外我在GitHub上上传了一张 baby.jpg 的图片,请你编写代码用 K-Means 聚类方法将它分割成 16 个部分。

链接:https://github.com/cystanford/kmeans/blob/master/baby.jpg

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精选留言(13)

  • 淡魂
    2019-02-13
    4
    请问老师。自己写Min-Max规范化公式的时候为什么不直接除以255,这样得到的数据也是在[0,1]之间,是因为那个值不可以为0吗?什么原因呢?

    编辑回复: 一个不错的问题,实际上都是一样的,只要能划分到[0,1]空间内,而且在变化的过程中不存在分母为0的情况即可。因为我们是缩放一个固定的尺寸,所以除以255,反变换的时候乘以255是没有问题的。你也可以自己修改运行下,同样可以得到结果。

  • mickey
    2019-02-28
    2
    import PIL.Image as image
    导入的是pillow包,而非pil包。
    pil包不支持64位,但是有pillow包代替用。
    展开
  • vortual
    2019-03-12
    1
    衷心希望老师能开一讲讲下数据规范化的问题。从之前的几讲总是遇到有些是minmax规范化,有些是需要正态分布,希望老师能讲下具体什么时候用哪种,而且规范化的好处,目前知道的是加快收敛和降低维度,但为啥还不是很清楚
  • 王彬成
    2019-02-23
    1
    新概念总结
    1、图像分割就是把图像分成若干个特定的、具有独特性质的区域并提出感兴趣目标的技术和过程。它是由图像处理到图像分析的关键步骤

    有一个问题,最后一个案例中,图像分割,输出原图有什么意义
    展开
  • third
    2019-02-19
    1
    问题:已经使用mm进行数据拟合转换了,为何还要使用np.mat()转换呢?作用在哪里?方便后面使用np.uint8吗?

    注意:实战的时候,保存图片为jpg格式
    如果是png格式的话,会出现4个值,导致赋值错误,(R, G, B, A)

    import PIL.Image as image
    import numpy as np
    import pandas as pd
    #载入数据
    def load_data(file):
        with open(file,'rb') as f:
            data=[]
            #打开文件
            img=image.open(f)
            width,height=img.size
            #获取特征数据
            for x in range(width):
                for y in range(height):
                    c1,c2,c3=img.getpixel((x,y))
                    data.append([c1,c2,c3])
            #进行mm规范化
            from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
            mm=MinMaxScaler()
            data=mm.fit_transform(data)
            return np.mat(data),width,height
    data,width,height=load_data('./27/baby.jpg')

    #进行聚类
    from sklearn.cluster import KMeans
    kmeans=KMeans(n_clusters=16)
    label=kmeans.fit_predict(data)

    #可视化
    #转换成图像矩阵
    label=label.reshape([width,height])
    #生成一张新图片
    # pic_1=image.new("L",(width,height))
    # #把像素信息写入
    # #方法1写入灰度值
    # for x in range(width):
    # for y in range(height):
    # #按照分类确定灰度值
    # pic_1.putpixel((x,y),int(label[x][y]*256/16))
    # pic_1.save('./27/baby.jpg')

    # #方法2
    # # 使用模组,将表示矩阵转换为各种颜色的矩阵
    # #使用label2rgb(label)*255转化,再把矩阵转化为unit8类型,无符号整数
    # from skimage import color
    # label_color=(color.label2rgb(label)*255).astype(np.uint8)
    # #似乎都需要进行颠倒处理
    # label_color=label_color.transpose(1,0,2)
    # #使用fromarray把矩阵生成图片
    # images=image.fromarray(label_color)
    # images.save('./27/baby_color_2.jpg')

    #方法3获取对应原图
    #创建新的图片
    imges1=image.new('RGB',(width,height))
    #写入图片
    for x in range(width):
        for y in range(height):
            #吧范围为0-255的数值投射到1-256
            #获取第一列即r的值
            c1=kmeans.cluster_centers_[label[x,y],0]
            c2 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1]
            c3 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]
            imges1.putpixel((x,y),(int(c1*256)-1,int(c2*256)-1,int(c3*256)-1))
    imges1.save('./27/baby_yasuo.jpg')
    展开

    编辑回复: 不用np.mat()也是OK的,jpg和png通道数确实需要注意。

  • 滨滨
    2019-04-05
    图像分割的主要工作在于数据的预处理,同时分割为几类需要人工指定这个很不方便
  • 三硝基甲苯
    2019-03-16
    一开始对那个baby的图进行16份用Kmeans分类后的颜色感觉到怪怪的,折腾了好久才反应过来,这个是个分类,还好醒悟的早,不然这个要纠结好久,以为自己哪里有问题。。
    展开
  • 宋晓明
    2019-03-12
    极客时间 pc界面终于改了。。之前的界面找某篇文章费死个劲
    展开
  • mickey
    2019-02-28
    # -*- coding: utf-8 -*-
    # 使用K-means对图像进行聚类,显示分割标识的可视化
    import numpy as np
    import PIL.Image as image
    from sklearn.cluster import KMeans
    from sklearn import preprocessing
    from skimage import color

    # 加载图像,并对数据进行规范化
    def load_data(filePath):
        # 读文件
        f = open(filePath,'rb')
        data = []
        # 得到图像的像素值
        img = image.open(f)
        # 得到图像尺寸
        width, height = img.size
        for x in range(width):
            for y in range(height):
                # 得到点(x,y)的三个通道值
                c1, c2, c3 = img.getpixel((x, y))
                data.append([c1, c2, c3])
        f.close()
        # 采用Min-Max规范化
        mm = preprocessing.MinMaxScaler()
        data = mm.fit_transform(data)
        return np.mat(data), width, height

    # 加载图像,得到规范化的结果img,以及图像尺寸
    img, width, height = load_data('./baby2.jpg')

    # 用K-Means对图像进行16聚类
    kmeans =KMeans(n_clusters=16)
    kmeans.fit(img)
    label = kmeans.predict(img)
    # 将图像聚类结果,转化成图像尺寸的矩阵
    label = label.reshape([width, height])
    # 将聚类标识矩阵转化为不同颜色的矩阵
    label_color = (color.label2rgb(label)*255).astype(np.uint8)
    label_color = label_color.transpose(1,0,2)
    images = image.fromarray(label_color)
    images.save('baby_16.jpg')
    展开
  • cua
    2019-02-28
    为什么会出现这个错误呢ValueError: too many values to unpack (expected 3)
  • 深白浅黑
    2019-02-19
    老师下面函数中,最后的参数代表什么意思?手册上显示的是n_feature,但没说具体的意义,不是很明白。
            c1 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]
            c2 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1]
            c3 = kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 0]
    展开

    编辑回复: 一个很好的问题,实际上label[x,y]是得到当前点的类别,kmeans.cluster_centers_可以得到某类别的数值,因为图像JPG是3个通道,所以通过kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 0],kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 1],kmeans.cluster_centers_[label[x, y], 2]可以获得这3个通道的数值,然后将这些数值作为当前点的数值。因为当前点已经被划分到了这个类别,所以数值是一致的。这样如果原来图像中有N种颜色,现在聚类数是16,相当于每个点的颜色值就变成了其中一个类别的颜色值,也就是变成了16种颜色,完成了聚类(降维)。

  • Rickie
    2019-02-14
    老师好,想请问下您聚类后得到的那张灰度图像有其他的设置吗?我使用跟您一样的代码,最后生成的图尺寸非常小,且一些细节并没有分类正确...不知道是什么原因?
    展开

    编辑回复: 可以找运营加到微信群里,我帮你看看。

  • 梁利文
    2019-02-14
    那连接只能在手机上看,在电脑上看不到,不方便看案例和操作
    展开
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